RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SUDS3-204ENST00000543473 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.36■□□□□ 0.85
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SUDS3-204ENST00000543473 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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SUDS3-204ENST00000543473 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 NLRP4Q96MN2 994 aa20.36■□□□□ 0.85
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SUDS3-204ENST00000543473 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SUDS3-204ENST00000543473 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.35■□□□□ 0.85
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