RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 EML1O00423 815 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ATP9BO43861 1147 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 COQ9O75208 318 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 KRT36O76013 467 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ARFIP2P53365 341 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CDK16Q00536 496 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 MCL1Q07820 350 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 UBE2SQ16763 222 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 MIPEPQ99797 713 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ANO3Q9BYT9 981 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 NPHS2Q9NP85 383 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 BTAF1O14981 1849 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TYROBPO43914 113 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TBX10O75333 385 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TMCC1O94876 653 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PYGLP06737 847 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TSHRP16473 764 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CRABP2P29373 138 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RFC4P35249 363 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PGM1P36871 562 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RGS2P41220 211 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 MFAP3P55082 362 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CDK18Q07002 472 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 MYCT1Q8N699 235 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SLC44A5Q8NCS7 719 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 NRG4Q8WWG1 115 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 HIC2Q96JB3 615 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 NLRP3Q96P20 1036 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ECSITQ9BQ95 431 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 NYXQ9GZU5 481 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.45□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 NFASCO94856 1347 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 FAM196BA6NMK8 535 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PSTPIP1O43586 416 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 LRRN2O75325 713 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SPAG7O75391 227 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RARBP10826 455 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PLS3P13797 630 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 MAPK4P31152 587 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ASPHQ12797 758 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 MORF4L2Q15014 288 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CBWD6Q4V339 395 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PCGF5Q86SE9 256 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 CHSY1Q86X52 802 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SKA1Q96BD8 255 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SAYSD1Q9NPB0 183 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 LMCD1Q9NZU5 365 aa11.44□□□□□ -0.58
LMO3-215ENST00000537304 HEY2Q9UBP5 337 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms