RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 CXorf38Q8TB03 319 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 SEMA4DQ92854 862 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF560Q96MR9 790 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 TMEM175Q9BSA9 504 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 CARNS1A5YM72 827 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 PODXLO00592 558 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 CLSTN1O94985 981 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 ALDH2P05091 517 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 SLC9A1P19634 815 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 PAX3P23760 479 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 BMP8BP34820 402 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 PBX1P40424 430 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 MYL6P60660 151 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 LMO3Q8TAP4 145 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 RAD9AQ99638 391 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.99■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 SCN1AP35498 2009 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 OR1G1P47890 313 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 TAF6P49848 677 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 CLCNKBP51801 687 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 UPP1Q16831 310 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF699Q32M78 642 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 NEK11Q8NG66 645 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 HPDLQ96IR7 371 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 NT5C1BQ96P26 610 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 COL4A6Q14031 1691 aa21.98■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 TLL1O43897 1013 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 SV2CQ496J9 727 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 VSTM4Q8IW00 320 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 FAM81BQ96LP2 452 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 NUP58Q9BVL2 599 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 CWH43Q9H720 699 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.97■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 PPEF2O14830 753 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 P4HA1P13674 534 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 CDC25BP30305 580 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 LRMPQ12912 555 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 FIBCD1Q8N539 461 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 IQCDQ96DY2 449 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.96■■□□□ 1.11
TSTA3-215ENST00000532308 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 NRP1O14786 923 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 B4GALT3O60512 393 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 LRRN2O75325 713 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 B3GAT3O94766 335 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 GALTP07902 379 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 LAG3P18627 525 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 KLK7P49862 253 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 BCAR1P56945 870 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 PTPN21Q16825 1174 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 DRC7Q8IY82 874 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 SIX2Q9NPC8 291 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.11e-8■■■■■ 80.2
TSTA3-215ENST00000532308 AAASQ9NRG9 546 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.95■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 KPNA7A9QM74 516 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 RFX1P22670 979 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 SLC11A1P49279 550 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 LILRA4P59901 499 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 TNNC1P63316 161 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 TATDN2Q93075 761 aa21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TSTA3-215ENST00000532308 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms