RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514421.1

CCL28-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 3

Gene CCL28, Length 577 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-204ENST00000514421 SPC24Q8NBT2 197 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 RABGGTAQ92696 567 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 SAAL1Q96ER3 474 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 KIF12Q96FN5 646 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PAAF1Q9BRP4 392 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 ZBP1Q9H171 429 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CHST7Q9NS84 486 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 INTS13Q9NVM9 706 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 MYH11P35749 1972 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CDH23Q9H251 3354 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 C2orf71A6NGG8 1288 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 F8W810 466 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PODXLO00592 558 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PDXKO00764 312 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PER2O15055 1255 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PAX3P23760 479 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 LRPAP1P30533 357 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CA8P35219 290 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PRCPP42785 496 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 TERF1P54274 439 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 DSG1Q02413 1049 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 SPAG1Q07617 926 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PAK1Q13153 545 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 MYBPC2Q14324 1141 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 COL19A1Q14993 1142 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 TMEM132DQ14C87 1099 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 SURF1Q15526 300 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 DUSP6Q16828 381 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 FUT10Q6P4F1 479 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CD300LGQ6UXG3 332 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 NT5DC4Q86YG4 428 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 C12orf56Q8IXR9 622 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 DRC7Q8IY82 874 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 EFHBQ8N7U6 833 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 XXYLT1Q8NBI6 393 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 BEST2Q8NFU1 509 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 TMEM174Q8WUU8 243 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 FBXL18Q96ME1 805 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 RXFP1Q9HBX9 757 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PRDM6Q9NQX0 595 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CACNG4Q9UBN1 327 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 C2CD2Q9Y426 696 aa9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 TRANK1O15050 2925 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 KIF4AO95239 1232 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 URODP06132 367 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 GLUD2P49448 558 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CCZ1BP86790 482 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PTPN14Q15678 1187 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 AAK1Q2M2I8 961 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 JADE1Q6IE81 842 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 TTI2Q6NXR4 508 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PDXDC1Q6P996 788 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL28-204ENST00000514421 RDH13Q8NBN7 331 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms