RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TTLL1O95922 423 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LPLP06858 475 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ALDH1A3P47895 512 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF134P52741 427 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NOMO3P69849 1222 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FPGSQ05932 587 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NOMO1Q15155 1222 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STON2Q8WXE9 905 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VPS16Q9H269 839 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRAMEF10O60809 474 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CYP2D6P10635 497 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SART3Q15020 963 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 Q6ZVL8 140 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LANCL2Q9NS86 450 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ERVV-2B6SEH9 535 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KPNA6O60684 536 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GATA3P23771 443 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NEK4P51957 841 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SEM1Q6ZVN7 128 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MKL1Q969V6 931 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TANGO6Q9C0B7 1094 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM140Q9NV12 185 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SERGEFQ9UGK8 458 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NEU2Q9Y3R4 380 aa5□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TUBB4AP04350 444 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NXPH1P58417 271 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RABEP1Q15276 862 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CEP78Q5JTW2 689 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NSMCE1Q8WV22 266 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SH2D3AQ9BRG2 576 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLC4Q9NSK0 619 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDHR4A6H8M9 788 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM83GA6ND36 823 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCNA2P16389 499 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GUCY1A2P33402 732 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCT8P50990 548 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ITIH3Q06033 890 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CT83Q5H943 113 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C11orf74Q86VG3 221 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMC1BQ8NDV3 1235 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MARK4Q96L34 752 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WDR27A2RRH5 827 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RFPL3O75679 317 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRT10P13645 584 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DRD4P21917 467 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLFN5Q08AF3 891 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UGT8Q16880 541 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PROSER3Q2NL68 480 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LILRB2Q8N423 598 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYOCQ99972 504 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCNU1A8MYU2 1149 aa4.96□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 JTBO76095 146 aa4.96□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FCER1AP12319 257 aa4.96□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CEP85Q6P2H3 762 aa4.96□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RAX2Q96IS3 184 aa4.96□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PBKQ96KB5 322 aa4.96□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DPP7Q9UHL4 492 aa4.96□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FPR1P21462 350 aa4.95□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LSSP48449 732 aa4.95□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDK17Q00537 523 aa4.95□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RBL2Q08999 1139 aa4.95□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DYRK1AQ13627 763 aa4.95□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BROXQ5VW32 411 aa4.95□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SNX19Q92543 992 aa4.95□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LDAHQ9H6V9 325 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms