RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 SNX12Q9UMY4 172 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 HYOU1Q9Y4L1 999 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 V9GYY5 206 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CTAGE15A4D2H0 777 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 LACTBL1A8MY62 500 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TREHO43280 583 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 RTN2O75298 545 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TFRCP02786 760 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 MMEP08473 750 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NFICP08651 508 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CTAGE8P0CG41 777 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 COL6A1P12109 1028 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 AXLP30530 894 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GRM5P41594 1212 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TUBB4BP68371 445 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 FMO1Q01740 532 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ELF2Q15723 593 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF699Q32M78 642 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TAF2Q6P1X5 1199 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NOTUMQ6P988 496 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CTAGE6Q86UF2 777 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PALB2Q86YC2 1186 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CD302Q8IX05 232 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CTAGE4Q8IX94 777 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM192Q8IY95 271 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NME8Q8N427 588 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD7Q92527 254 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ACAP3Q96P50 834 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 OSMRQ99650 979 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 HTATIP2Q9BUP3 242 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ISCUQ9H1K1 167 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CNTN6Q9UQ52 1028 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GINS2Q9Y248 185 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP290O15078 2479 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 LTBP2Q14767 1821 aa11.12□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 UMODL1Q5DID0 1318 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 KAT6AQ92794 2004 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CDH23Q9H251 3354 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NCK2O43639 380 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NPTXRO95502 500 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PGK1P00558 417 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CST3P01034 146 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCB4P21439 1286 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 FGFR4P22455 802 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SNX17Q15036 470 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TCEAL1Q15170 157 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TEX35Q5T0J7 233 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 JADE1Q6IE81 842 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC27A1Q6PCB7 646 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CXCL17Q6UXB2 119 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM72Q6ZMU5 477 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 RHOT2Q8IXI1 618 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 UBR7Q8N806 425 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC57Q8N9N7 239 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CAGE1Q8TC20 777 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 RABGGTAQ92696 567 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TLR10Q9BXR5 811 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 THAP2Q9H0W7 228 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ACP6Q9NPH0 428 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 C2CD2Q9Y426 696 aa11.11□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SRGAP2O75044 1071 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAMTS4O75173 837 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 FTCDO95954 541 aa11.1□□□□□ -0.63
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