RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	TTC26	A0AVF1	554 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	LACTBL1	A8MY62	500 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	PRRG1	O14668	218 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	SYN3	O14994	580 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	CLDN3	O15551	220 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM189A1	O60320	539 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	VNN2	O95498	520 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	PLCG1	P19174	1290 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	MCM4	P33991	863 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	SMTN	P53814	917 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ZPBP2	Q6X784	338 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	USP49	Q70CQ1	688 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	DDX12P	Q92771	950 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	BICD1	Q96G01	975 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	CORO1B	Q9BR76	489 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269		R4GN57	208 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF292	O60281	2723 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	FRYL	O94915	3013 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	TISP43	B9A030	160 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	CLTA	P09496	248 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	OR4Q2	P0C623	313 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ATF2	P15336	505 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	STARD6	P59095	220 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ADCY1	Q08828	1119 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ZBTB6	Q15916	424 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	MTSS1L	Q765P7	747 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	PJA1	Q8NG27	643 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	FIZ1	Q96SL8	496 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	CEP72	Q9P209	647 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	TBX20	Q9UMR3	447 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	MYH11	P35749	1972 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	SHISA7	A6NL88	538 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269		H7C4K7	107 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269		K7ENM7	598 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	MOSPD3	O75425	235 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM13A	O94988	1023 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	LRG1	P02750	347 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	GJA1	P17302	382 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	PTPN2	P17706	415 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	FCAR	P24071	287 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	LRPAP1	P30533	357 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ELF1	P32519	619 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	UBA7	P41226	1012 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	LIG4	P49917	911 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	CDR1	P51861	262 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF131	P52739	623 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	RTL10	Q7L3V2	364 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ADSSL1	Q8N142	457 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	MYCT1	Q8N699	235 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	RAD54L	Q92698	747 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	AK8	Q96MA6	479 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	KCND2	Q9NZV8	630 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	NCAN	O14594	1321 aa		12.96	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269		A0A0B4J269	797 aa		12.96	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		12.96	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269		M0QZQ0	153 aa		12.96	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	SPTLC1	O15269	473 aa		12.96	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	PIGR	P01833	764 aa		12.96	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	TWF1	Q12792	350 aa		12.96	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	GRM2	Q14416	872 aa		12.96	□□□□□ -0.33
FAM204A-208	ENST00000487269	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		12.96	□□□□□ -0.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms