RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483973.5

TRAPPC10-210, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC10, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-210ENST00000483973 TCHPQ9BT92 498 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF263O14978 683 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 SYN3O14994 580 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 GJA1P17302 382 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 TGM1P22735 817 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 MCM4P33991 863 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 CCR3P51677 355 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 TWF1Q12792 350 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 VITQ6UXI7 678 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 SMARCD2Q92925 531 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 ACAP3Q96P50 834 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 CDT1Q9H211 546 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 MICAL2O94851 1124 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 TDGF1P13385 188 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 CPB1P15086 417 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 CCNE1P24864 410 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 CXCL12P48061 93 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 PEX3P56589 373 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 ECM1Q16610 540 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 TPGS2Q68CL5 300 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 YAF2Q8IY57 180 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 IER2Q9BTL4 223 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 ASAH2Q9NR71 780 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 CEP72Q9P209 647 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 MUTP22033 750 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 KCNA4P22459 653 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 SATB1Q01826 763 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 TEAD2Q15562 447 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 XKR4Q5GH76 650 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF280DQ6N043 979 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 DDX12PQ92771 950 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 MOSPD3O75425 235 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 RETP07949 1114 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 MCF2P10911 925 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 KCNE1P15382 129 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 NPTX2P47972 431 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 FNTBP49356 437 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 ANAPC15P60006 121 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 PPM1JQ5JR12 505 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 TTC38Q5R3I4 469 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 APPL2Q8NEU8 664 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 SUSD3Q96L08 255 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 TCHHQ07283 1943 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 HRO43593 1189 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 HIP1RO75146 1068 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 ADRB1P08588 477 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 CHRNB1P11230 501 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC10-210ENST00000483973 DMWDQ09019 674 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms