RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PALB2Q86YC2 1186 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 SUSD3Q96L08 255 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 VWA8A3KMH1 1905 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 SYN3O14994 580 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 ADAM12O43184 909 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 TGM5O43548 720 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 GLUD1P00367 558 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 MCM4P33991 863 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 MTRRQ9UBK8 725 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-211ENST00000480301 ANO9A1A5B4 782 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 PIRO00625 290 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CLIC2O15247 247 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 RHOBTB3O94955 611 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.226e-51■□□□□ 10.8
ACTB-211ENST00000480301 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 ITIH3Q06033 890 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CD320Q9NPF0 282 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CDH22Q9UJ99 828 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 ANK1P16157 1881 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 M0QZQ0 153 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 SPATA31D3P0C874 917 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 ZP2Q05996 745 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 DPP3Q9NY33 737 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 ZNF233A6NK53 670 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF10AO00220 468 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 SPTLC1O15269 473 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 OR1D2P34982 312 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 LILRA4P59901 499 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D4O60343 1298 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 WEE2P0C1S8 567 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CYP2J2P51589 502 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 PNOCQ13519 176 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 RAB33AQ14088 237 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 KCNB1Q14721 858 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CES5AQ6NT32 575 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 APPL2Q8NEU8 664 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 FAM84AQ96KN4 292 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 TIGD1Q96MW7 591 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 DPP7Q9UHL4 492 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 PLXNA3P51805 1871 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 GPR149Q86SP6 731 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 GJD3Q8N144 294 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 RDH13Q8NBN7 331 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 H7C4K7 107 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 RFPL2O75678 378 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 PAPLNO95428 1278 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 PAX3P23760 479 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.65■■□□□ 1.22
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