RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	FNIP2	Q9P278	1114 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLIC2	O15247	247 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF202	O95125	648 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP3A5	P20815	502 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	LILRA6	Q6PI73	481 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR65	Q8IYL9	337 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	GJD3	Q8N144	294 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPD1L	Q8N335	351 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SUSD3	Q96L08	255 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM206	Q9H813	350 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	EXOC1	Q9NV70	894 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	C2CD2	Q9Y426	696 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANO9	A1A5B4	782 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959		M0QZQ0	153 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	EXTL3	O43909	919 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBC1D4	O60343	1298 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR1D2	P34982	312 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP2J2	P51589	502 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ROR1	Q01973	937 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNOC	Q13519	176 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD302	Q8IX05	232 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	BEST2	Q8NFU1	509 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CXorf38	Q8TB03	319 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ASB7	Q9H672	318 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP25	Q9UHP3	1055 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM50B	Q9Y247	325 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	OBSL1	O75147	1896 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTPRD	P23468	1912 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR27	A2RRH5	827 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIR	O00625	290 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYN3	O14994	580 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR4Q2	P0C623	313 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CREM	Q03060	361 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ITIH3	Q06033	890 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	POSTN	Q15063	836 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR149	Q86SP6	731 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM209	Q96SK2	561 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	DPP3	Q9NY33	737 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	DERA	Q9Y315	318 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAPPC3	O43617	180 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZMYND10	O75800	440 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	RHOBTB3	O94955	611 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL18RAP	O95256	599 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAPLN	O95428	1278 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	VNN2	O95498	520 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ITGB3	P05106	788 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	C8A	P07357	584 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDR1	P51861	262 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARPP19	P56211	112 aa		12.03	□□□□□ -0.48

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