RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PPP1R37	O75864	691 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	NR3C1	P04150	777 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	NFIL3	Q16649	462 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	NUP58	Q9BVL2	599 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364		K7ENM7	598 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CLIC2	O15247	247 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	GALT	P07902	379 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PLS3	P13797	630 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	KRT9	P35527	623 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	RAB27A	P51159	221 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	MTERF2	Q49AM1	385 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	FIGN	Q5HY92	759 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	FLCN	Q8NFG4	579 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	LPP	Q93052	612 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A087WZ62	844 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A1W2PQJ5	194 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CCP110	O43303	1012 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	DRP2	Q13474	957 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ALCAM	Q13740	583 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	MTF1	Q14872	753 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	XKR3	Q5GH77	459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF623	O75123	536 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TNNT1	P13805	278 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	KLRC2	P26717	231 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CASP4	P49662	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TDG	Q13569	410 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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