RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 EXOC1Q9NV70 894 aa21.59■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 SYN3O14994 580 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 TGM5O43548 720 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 EXTL3O43909 919 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF202O95125 648 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 KANK3Q6NY19 840 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 LILRA6Q6PI73 481 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 TMC5Q6UXY8 1006 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 SUSD3Q96L08 255 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 MTRRQ9UBK8 725 aa21.58■■□□□ 1.05
CTPS1-206ENST00000470271 C19orf67A6NJJ6 358 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 SPATA31D3P0C874 917 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 MTHFRP42898 656 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 PSMD2Q13200 908 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 GPD1LQ8N335 351 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 RIPOR3Q96MK2 946 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CDH22Q9UJ99 828 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 ADAM12O43184 909 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 TGFB1I1O43294 461 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 WEE2P0C1S8 567 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 ATAT1Q5SQI0 421 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 APPL2Q8NEU8 664 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 DPP3Q9NY33 737 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.56■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 PRR29P0C7W0 189 aa21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 OR1D2P34982 312 aa21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 STK4Q13043 487 aa21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 RAB33AQ14088 237 aa21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 GPR149Q86SP6 731 aa21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.55■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 ANO9A1A5B4 782 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF233A6NK53 670 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 H7C4K7 107 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 M0QZQ0 153 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 PIRO00625 290 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 PPEF2O14830 753 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 PAX3P23760 479 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 WNT7BP56706 349 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 LILRA4P59901 499 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 DPYDQ12882 1025 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 POMKQ9H5K3 350 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.54■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 LOC730098B7Z3J9 87 aa21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CLIC2O15247 247 aa21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 RFPL2O75678 378 aa21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.53■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 SCN1AP35498 2009 aa21.52■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D4O60343 1298 aa21.52■■□□□ 1.04
CTPS1-206ENST00000470271 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.52■■□□□ 1.04
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