RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465399.5

ATG4B-214, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-214ENST00000465399 SFI1A8K8P3 1242 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SPTLC1O15269 473 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MICAL2O94851 1124 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CPB1P15086 417 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 GUCY2CP25092 1073 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 IL17AQ16552 155 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PRSS36Q5K4E3 855 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CYP4A22Q5TCH4 519 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 KCNK18Q7Z418 384 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 DDX12PQ92771 950 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TBC1D32Q96NH3 1257 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ZFP14Q9HCL3 533 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MAFFQ9ULX9 164 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 DMXL1Q9Y485 3027 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CACNA1AO00555 2505 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CLDN3O15551 220 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SEC24AO95486 1093 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PLS3P13797 630 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ADCY1Q08828 1119 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ZPBP2Q6X784 338 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 LEMD2Q8NC56 503 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CLDN23Q96B33 292 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 RMDN1Q96DB5 314 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 BRD9Q9H8M2 597 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 KCND2Q9NZV8 630 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TCHHQ07283 1943 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 FRYLO94915 3013 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 DNAH14Q0VDD8 3507 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 H0YCG3 227 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MAN2B1O00754 1011 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MAPTP10636 758 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 FCARP24071 287 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MCL1Q07820 350 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TWF1Q12792 350 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 GRM2Q14416 872 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SEZ6Q53EL9 994 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MCTP1Q6DN14 999 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 IRF7Q92985 503 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 BICD1Q96G01 975 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ASB16Q96NS5 453 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ASAH2Q9NR71 780 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 NCDNQ9UBB6 729 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 TSC2P49815 1807 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CXCL8P10145 99 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PSMC3P17980 439 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CCR2P41597 374 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 HYIQ5T013 277 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 POTEHQ6S545 545 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SMARCD2Q92925 531 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 F5P12259 2224 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 VWA3AA6NCI4 1184 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 XPOTO43592 962 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 CLTAP09496 248 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PLA2G4BP0C869 781 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 MYL4P12829 197 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PPP2R3AQ06190 1150 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-214ENST00000465399 PLD1Q13393 1074 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms