RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPEF2O14830 753 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYN3O14994 580 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOM1L1O75674 476 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADRB2P07550 413 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 RHOP08100 348 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLA2G4BP0C869 781 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXCL8P10145 99 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEBPBP17676 345 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 MCL1Q07820 350 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 MCTP1Q6DN14 999 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZPBP2Q6X784 338 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 RTL10Q7L3V2 364 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 PJA1Q8NG27 643 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF461Q8TAF7 563 aa9.24□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 TIPINQ9BVW5 301 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLIQ9UNA4 740 aa9.24□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 SPTBN2O15020 2390 aa9.23□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ATF2P15336 505 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRPAP1P30533 357 aa9.23□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 CLCN6P51797 869 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 GUCY2FP51841 1108 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF131P52739 623 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 BEST2Q8NFU1 509 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX12PQ92771 950 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC3Q9BY71 257 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEP72Q9P209 647 aa9.23□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.23□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.23□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 CD72P21854 359 aa9.22□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPHA5P54756 1037 aa9.22□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 MTSS1LQ765P7 747 aa9.22□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.22□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.22□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.22□□□□□ -0.93
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GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.22□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 R4GN57 208 aa9.22□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 LACTBL1A8MY62 500 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPTLC1O15269 473 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLDN3O15551 220 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC26A4O43511 780 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 ECI2O75521 394 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRG1P02750 347 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLTAP09496 248 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4Q2P0C623 313 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 SP9P0CG40 484 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTPN2P17706 415 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLCG1P19174 1290 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP3A5P20815 502 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 MCM4P33991 863 aa9.21□□□□□ -0.94
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARPP19P56211 112 aa9.21□□□□□ -0.94
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