RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
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RPRD1B-202ENST00000449186 LZTS1Q9Y250 596 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 C2CD2Q9Y426 696 aa11.91□□□□□ -0.5
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RPRD1B-202ENST00000449186 COL6A3P12111 3177 aa11.91□□□□□ -0.5
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RPRD1B-202ENST00000449186 LTBRP36941 435 aa11.88□□□□□ -0.51
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RPRD1B-202ENST00000449186 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 VAMP7P51809 220 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 MYL6P60660 151 aa11.88□□□□□ -0.51
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RPRD1B-202ENST00000449186 DUSP6Q16828 381 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 USP41Q3LFD5 358 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 KIAA1841Q6NSI8 718 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 PALB2Q86YC2 1186 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 SUSD3Q96L08 255 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 SENP8Q96LD8 212 aa11.88□□□□□ -0.51
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