RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 PANK4Q9NVE7 773 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 WNT16Q9UBV4 365 aa13.58□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 SPTBN4Q9H254 2564 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 FAM186AA6NE01 2351 aa13.57□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 ADAM12O43184 909 aa13.57□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 FAM13AO94988 1023 aa13.57□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 ZNF445P59923 1031 aa13.57□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 ADSSL1Q8N142 457 aa13.57□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 ARHGEF3Q9NR81 526 aa13.57□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 FBXW11Q9UKB1 542 aa13.57□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 STX1AQ16623 288 aa13.56□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 NLRP12P59046 1061 aa13.55□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 EHHADHQ08426 723 aa13.55□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa13.55□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 LRSAM1Q6UWE0 723 aa13.55□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 PARM1Q6UWI2 310 aa13.55□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 SEL1LQ9UBV2 794 aa13.55□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 R4GN57 208 aa13.55□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 SFI1A8K8P3 1242 aa13.54□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 FAM26FQ5R3K3 315 aa13.54□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 ING5Q8WYH8 240 aa13.54□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 TSPY26PQ9H489 355 aa13.54□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 C17orf75Q9HAS0 396 aa13.54□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
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PRAME-208ENST00000438888 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 DOCK8Q8NF50 2099 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 CCDC169A6NNP5 214 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 LRRN2O75325 713 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 PAPLNO95428 1278 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 C1RP00736 705 aa13.53□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 TKTP29401 623 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
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