RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436949.5

SEMA3A-204, Transcript of semaphorin 3A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEMA3A, Length 2,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3A-204ENST00000436949 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.13□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.13□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ACCSQ96QU6 501 aa7.13□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.13□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.13□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.13□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 COL20A1Q9P218 1284 aa7.13□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 A0A1W2PPM1 405 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 WDR91A4D1P6 747 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ENO4A6NNW6 628 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 VIL1P09327 827 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 RFX1P22670 979 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GCAP28676 217 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GCKP35557 465 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 RARRES1P49788 294 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MFAP3P55082 362 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ATP11AP98196 1134 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 PTK6Q13882 451 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 P3H1Q32P28 736 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 VSIG1Q86XK7 387 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TTC8Q8TAM2 541 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 HAUS1Q96CS2 278 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MAGEB18Q96M61 343 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CSRNP1Q96S65 589 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MYH11P35749 1972 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 UBE4BO95155 1302 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 LTBP1Q14766 1721 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 NFKBIEO00221 500 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ENTPD5O75356 428 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GAS8O95995 478 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 PDHA1P08559 390 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 T-ENOLP0DO92 83 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 FDX1P10109 184 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 PLS3P13797 630 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CCNB1P14635 433 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 EPHB2P29323 1055 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GAD2Q05329 585 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TAF11Q15544 211 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SLC1A5Q15758 541 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ZNF365Q70YC5 407 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SV2AQ7L0J3 742 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ATL2Q8NHH9 583 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MAML1Q92585 1016 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 IFT74Q96LB3 600 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TMEM206Q9H813 350 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 RAB20Q9NX57 234 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.12□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CLRN2A0PK11 232 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 NFIBO00712 420 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MAP3K13O43283 966 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SORBS3O60504 671 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CDH16O75309 829 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CNGA1P29973 690 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ATP5DP30049 168 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MAGEA4P43358 317 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TUBP50607 506 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 WNT7BP56706 349 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 OVGP1Q12889 678 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 STRN3Q13033 797 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 DGKZQ13574 1117 aa7.11□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms