RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.9■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 PROB1E7EW31 1015 aa21.9■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 H7C4K7 107 aa21.9■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 OGTO15294 1046 aa21.9■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 RHOP08100 348 aa21.9■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 ARPP19P56211 112 aa21.9■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 GTF2BQ00403 316 aa21.9■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.9■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.9■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.9■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.9■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 KIF12Q96FN5 646 aa21.9■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.9■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.9■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
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HLA-B-250ENST00000434333 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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HLA-B-250ENST00000434333 STRA6Q9BX79 667 aa21.85■■□□□ 1.09
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HLA-B-250ENST00000434333 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-250ENST00000434333 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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