RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432255.6

CTCFL-208, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 2,955 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-208ENST00000432255 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 VNN1O95497 513 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 GAS8O95995 478 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 EDN1P05305 212 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CETPP11597 493 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 DYNLT1P63172 113 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 PLCB3Q01970 1234 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 DRP2Q13474 957 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CNGA2Q16280 664 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CYP1B1Q16678 543 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 IFNB1P01574 187 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 PAEPP09466 180 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 TNFSF9P41273 254 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ORC1Q13415 861 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 TCP11Q8WWU5 503 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 PICK1Q9NRD5 415 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 MAPK13O15264 365 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 SPAG7O75391 227 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 STBD1O95210 358 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 BACE1P56817 501 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 GPATCH11Q8N954 259 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 MORC4Q8TE76 937 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 EXTL3O43909 919 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ZBTB7AO95365 584 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 BRAFP15056 766 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 TMED2Q15363 201 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 P3H1Q32P28 736 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 FBXL18Q96ME1 805 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 TIPINQ9BVW5 301 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.63□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CLTAP09496 248 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ATP4AP20648 1035 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 GCNT1Q02742 428 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CUL2Q13617 745 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 MPP2Q14168 576 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 LIN9Q5TKA1 542 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CCT6BQ92526 530 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 C5orf60A6NFR6 353 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 BANF1O75531 89 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 WEE2P0C1S8 567 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 GLRA2P23416 452 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 RXRBP28702 533 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 MAMLD1Q13495 774 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 TNFAIP1Q13829 316 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ZACNQ401N2 412 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 DPH6Q7L8W6 267 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.62□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 PROSCO94903 275 aa14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 GTF2H1P32780 548 aa14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ATL2Q8NHH9 583 aa14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 GPRASP2Q96D09 838 aa14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 MCEEQ96PE7 176 aa14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTCFL-208ENST00000432255 ZNF302Q9NR11 478 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms