RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.24■□□□□ 0.03
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PTPRU-204ENST00000428026 VHLP40337 213 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PTK7Q13308 1070 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC134Q9H6E4 229 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRU-204ENST00000428026 APOL1O14791 398 aa15.21■□□□□ 0.03
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