RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP3A5	P20815	502 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	SCNN1G	P51170	649 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	TTC3	P53804	2025 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	RBP5	P82980	135 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	GCNT1	Q02742	428 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	TAF4B	Q92750	862 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	TATDN2	Q93075	761 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM81B	Q96LP2	452 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	INPPL1	O15357	1258 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	NRDC	O43847	1150 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	EVI5	O60447	810 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	TH	P07101	528 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	CSF2RA	P15509	400 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ATIC	P31939	592 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	MFAP3	P55082	362 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	CCZ1B	P86790	482 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	GRIK3	Q13003	919 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM139	Q8IV31	216 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	KAT5	Q92993	513 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	SCN1A	P35498	2009 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	PPEF2	O14830	753 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	OFD1	O75665	1012 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	POMC	P01189	267 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	PFKM	P08237	780 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	FGFR1	P11362	822 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	FECH	P22830	423 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	SOX5	P35711	763 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	STAT1	P42224	750 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	CUL2	Q13617	745 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	IKBKE	Q14164	716 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	NAB2	Q15742	525 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ASIC2	Q16515	512 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	MEA1	Q16626	185 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	SHC3	Q92529	594 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF560	Q96MR9	790 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ARID3A	Q99856	593 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAAP20-208	ENST00000420964	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms