RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 SPAG1Q07617 926 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 APPL2Q8NEU8 664 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF292O60281 2723 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 FCARP24071 287 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MTAPQ13126 283 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TPGS2Q68CL5 300 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MCTP1Q6DN14 999 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 KCNK18Q7Z418 384 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 DDX12PQ92771 950 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 DNASE1L2Q92874 299 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 BICD1Q96G01 975 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SUSD3Q96L08 255 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ASAH2Q9NR71 780 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 NOTCH4Q99466 2003 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PROZP22891 400 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 VIPR2P41587 438 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MAPK7Q13164 816 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 CLDN23Q96B33 292 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ASB16Q96NS5 453 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 USP18Q9UMW8 372 aa21.09■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MAN2B1O00754 1011 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ABLIM1O14639 778 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TBC1D4O60343 1298 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 OR4Q2P0C623 313 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 CXCL8P10145 99 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SMTNP53814 917 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TEAD2Q15562 447 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 IL17AQ16552 155 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SMARCD2Q92925 531 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 IRF7Q92985 503 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 KIF12Q96FN5 646 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 CEP72Q9P209 647 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PIAS3Q9Y6X2 628 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TRIP11Q15643 1979 aa21.08■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF263O14978 683 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 CLDN3O15551 220 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 TOM1L1O75674 476 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 PSMC3P17980 439 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 LPAL2Q16609 132 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 VITQ6UXI7 678 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 YAF2Q8IY57 180 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 FAM3CQ92520 227 aa21.07■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 LAD1O00515 517 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 PLS3P13797 630 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.961e-6■□□□□ 11.3
UBXN4-202ENST00000415164 USP37Q86T82 979 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 TIPINQ9BVW5 301 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 YIPF1Q9Y548 306 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 DNAH14Q0VDD8 3507 aa21.06■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.05■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 MICAL2O94851 1124 aa21.05■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 GUCY2CP25092 1073 aa21.05■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.05■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 PPP2R5DQ14738 602 aa21.05■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.05■□□□□ 0.96
UBXN4-202ENST00000415164 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms