RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 GTF3C4Q9UKN8 822 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SORBS3O60504 671 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 ALADP13716 330 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 KCNJ2P63252 427 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 PRKCEQ02156 737 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 KRT17Q04695 432 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 CRYMQ14894 314 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 GNPTABQ3T906 1256 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 RHBDF2Q6PJF5 856 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 FBXL18Q96ME1 805 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 KREMEN1Q96MU8 473 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 CREB1P16220 341 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 KRT39Q6A163 491 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF653Q96CK0 615 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 CYP26B1Q9NR63 512 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 UVRAGQ9P2Y5 699 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 GGT7Q9UJ14 662 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 A0A1B0GUA9 196 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 DLATP10515 647 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 FMO1Q01740 532 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 BNIP1Q12981 228 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 PRKG1Q13976 671 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 NUGGCQ68CJ6 796 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 GPC2Q8N158 579 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 PPM1KQ8N3J5 372 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 MFSD14AQ96MC6 490 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 PLCD4Q9BRC7 762 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 COQ4Q9Y3A0 265 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 O00370 1275 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 FSCN2O14926 492 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 CLDN3O15551 220 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 ITIH2P19823 946 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 RTP1P59025 263 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SGO2Q562F6 1265 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 CKAP2Q8WWK9 683 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 POMGNT1Q8WZA1 660 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 PLVAPQ9BX97 442 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM8AQ9HCN3 771 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 MYPNQ86TC9 1320 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 CYP26A1O43174 497 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 GJB6O95452 261 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 RPSAP08865 295 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SCP2P22307 547 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 COPS2P61201 443 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SLC47A2Q86VL8 602 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 TMC2Q8TDI7 906 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 CHKAP35790 457 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SP2Q02086 613 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SPATA21Q7Z572 469 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.771e-7■■□□□ 12.2
FAAP20-206ENST00000414253 AGAP11Q8TF27 550 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 C1orf54Q8WWF1 131 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 MAF1Q9H063 256 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 ASIC3Q9UHC3 531 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 WDR90Q96KV7 1748 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 TTC4O95801 387 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 MFAP3P55082 362 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 MYO1EQ12965 1108 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SHC3Q92529 594 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 KCNK9Q9NPC2 374 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 ACP6Q9NPH0 428 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 GPC3P51654 580 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 CYP24A1Q07973 514 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 ANKRD42Q8N9B4 389 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 NSMCE1Q8WV22 266 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SNF8Q96H20 258 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 C15orf41Q9Y2V0 281 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 L3MBTL1Q9Y468 752 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 ANP32DO95626 131 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SLC8A3P57103 927 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 XKR3Q5GH77 459 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 TAS1R3Q7RTX0 852 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-206ENST00000414253 HELQQ8TDG4 1101 aa26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms