RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 CALCOCO2Q13137 446 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 PORCNQ9H237 461 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 ANAPC7Q9UJX3 599 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 CAND2O75155 1236 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 MMP13P45452 471 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 SNAPC2Q13487 334 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 EMC2Q15006 297 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 MFSD5Q6N075 450 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 RABEP2Q9H5N1 569 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 TMEM134Q9H6X4 195 aa25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 HLA-DRAP01903 254 aa25.35■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 SLC29A2Q14542 456 aa25.35■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 ERMARDQ5T6L9 678 aa25.35■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 LIN9Q5TKA1 542 aa25.35■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.35■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 RAPGEF5Q92565 580 aa25.35■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 P3H4Q92791 437 aa25.35■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 BTBD6Q96KE9 485 aa25.35■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 PPME1Q9Y570 386 aa25.35■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 RIPK2O43353 540 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 PSTPIP1O43586 416 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 ARL2P36404 184 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 NSFP46459 744 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 AP3M2P53677 418 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 SOX10P56693 466 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 SGO2Q562F6 1265 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 MON1BQ7L1V2 547 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 CHST13Q8NET6 341 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 PROSCO94903 275 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 SHBGP04278 402 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 ACO1P21399 889 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 RFC5P40937 340 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 PTK6Q13882 451 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 PLCB4Q15147 1175 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 STXBP2Q15833 593 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 SEMA4AQ9H3S1 761 aa25.34■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD65E5RJM6 399 aa25.33■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 OATP04181 439 aa25.33■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R7Q15435 360 aa25.33■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 CCDC134Q9H6E4 229 aa25.33■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 EFCC1Q9HA90 598 aa25.33■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 ZNF302Q9NR11 478 aa25.33■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 TNNI1P19237 187 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 TMOD1P28289 359 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 GTF2A2P52657 109 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 GRM1Q13255 1194 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CUL2Q13617 745 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CCL15Q16663 113 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 RHBDF2Q6PJF5 856 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 MICALL1Q8N3F8 863 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CGRRF1Q99675 332 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 SCINQ9Y6U3 715 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 BTBD19C9JJ37 291 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CLDN3O15551 220 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 GAS8O95995 478 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 PIK3CAP42336 1068 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 MTERF2Q49AM1 385 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 BBOF1Q8ND07 529 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 CEP89Q96ST8 783 aa25.32■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 A0A0B4J269 797 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 K7ERI5 159 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 AOC2O75106 756 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 RRM1P23921 792 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 PACS2Q86VP3 889 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 ATL2Q8NHH9 583 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 DEPTORQ8TB45 409 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 SNF8Q96H20 258 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.31■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 PEX10O60683 326 aa25.3■■□□□ 1.64
PMS1-205ENST00000409985 VNN1O95497 513 aa25.3■■□□□ 1.64
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