RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 AIPL1Q9NZN9 384 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 INPP5DQ92835 1189 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 GLI2P10070 1586 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A1W2PQJ5 194 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 RALAP11233 206 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 NEK2P51955 445 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 DNAL1Q4LDG9 190 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 MASTLQ96GX5 879 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 SPATA33Q96N06 139 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 RUBCNLQ9H714 662 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 TUFT1Q9NNX1 390 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 NEO1Q92859 1461 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ZBTB39O15060 712 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 VCPP55072 806 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 KDM7AQ6ZMT4 941 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 THEM5Q8N1Q8 247 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 PBXIP1Q96AQ6 731 aa16.01■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 CRB1P82279 1406 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 RPS6KA4O75676 772 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 HERVK_113P62684 666 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM71DQ8N9W8 422 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM167AQ96KS9 214 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 TPCN2Q8NHX9 752 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 OTULINQ96BN8 352 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 BATF3Q9NR55 127 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 TEKT2Q9UIF3 430 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A087X0T9 212 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 CAND2O75155 1236 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM228BP0C875 321 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 VCAM1P19320 739 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 TRPC1P48995 793 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 RCN1Q15293 331 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 FAXCQ5TGI0 409 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 CCDC33Q8N5R6 958 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 KCNA4P22459 653 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 TEX9Q8N6V9 391 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 RMDN1Q96DB5 314 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ZBTB10Q96DT7 871 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 MAD2L2Q9UI95 211 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 MAP3K6O95382 1288 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ZCCHC18P0CG32 403 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 SCTRP47872 440 aa16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 CLEC4FQ8N1N0 589 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 MAGEB5Q9BZ81 275 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 LMCD1Q9NZU5 365 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM247A6NEH6 219 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM253P0C7T8 217 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF543Q08ER8 600 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 NCOA4Q13772 614 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 NSL1Q96IY1 281 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 NARFQ9UHQ1 456 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ADCK1Q86TW2 530 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 SPATA18Q8TC71 538 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 HPS4Q9NQG7 708 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 PHTF1Q9UMS5 762 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 AGAP1Q9UPQ3 857 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 TPI1P60174 286 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 TAP1Q03518 808 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 MAPRE2Q15555 327 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM111AQ96PZ2 611 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 CST8O60676 142 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 PDGFRBP09619 1106 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 GYS1P13807 737 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 C6orf10Q5SRN2 563 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 PKD2L2Q9NZM6 624 aa15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 FLT1P17948 1338 aa15.98■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.98■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 PRKCBP05771 671 aa15.98■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 PCSK7Q16549 785 aa15.98■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 UBA3Q8TBC4 463 aa15.98■□□□□ 0.15
PTGFRN-201ENST00000393203 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms