RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYH10P35580 1976 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRIQ4A6NIV6 560 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 NCAM2O15394 837 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 B3GAT3O94766 335 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABLIM3O94929 683 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF806P0C7X5 589 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFNAR1P17181 557 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 PSMC3P17980 439 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 LIG1P18858 919 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 AXLP30530 894 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 MPLP40238 635 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 RARRES1P49788 294 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 LIMK1P53667 647 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 RCAN1P53805 252 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 CREMQ03060 361 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 TWF1Q12792 350 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 UPP1Q16831 310 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSGA10IPQ3SY00 556 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL31Q6EBC2 164 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP68Q76N32 757 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR5BQ86VZ2 330 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 TPH2Q8IWU9 490 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 STKLD1Q8NE28 680 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC148Q8NFR7 591 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMARCD2Q92925 531 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 HHIPQ96QV1 700 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 NELL2Q99435 816 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 AGXT2Q9BYV1 514 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADAM33Q9BZ11 813 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBXL5Q9UKA1 691 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLK13Q9UKR3 277 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 INVSQ9Y283 1065 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 MGAQ8IWI9 3026 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 KNL1Q8NG31 2342 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1W2PRU2 124 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 LNP1A1A4G5 178 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYBPHLA2RUH7 354 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 C4orf47A7E2U8 309 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAN2B1O00754 1011 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRRG1O14668 218 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 NR1I2O75469 434 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRG1P02750 347 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 THP07101 528 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPN2P17706 415 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCKDHBP21953 392 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPS6KB1P23443 525 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 EPHA5P54756 1037 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 NRLP54845 237 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP4F8P98187 520 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 FCHO2Q0JRZ9 810 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 STK3Q13188 491 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 NR5A1Q13285 461 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 EPHA7Q15375 998 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 UVSSAQ2YD98 709 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLK5Q496M5 336 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF43Q68DV7 783 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM68Q6AZZ1 485 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 MOXD1Q6UVY6 613 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 GAREM2Q75VX8 874 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 MFSD6LQ8IWD5 586 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 DAGLBQ8NCG7 672 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF461Q8TAF7 563 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 BICD2Q8TD16 824 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCP11Q8WWU5 503 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 GAB3Q8WWW8 586 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNB2Q92953 911 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 IRF7Q92985 503 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM209Q96SK2 561 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RNU6-171P-201ENST00000384354 EDEM2Q9BV94 578 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms