RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 TNNC2P02585 160 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM191BP0C7N4 346 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 FGFR3P22607 806 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 KLRC2P26717 231 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PNPLA4P41247 253 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNQ1P51787 676 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAM15Q13444 863 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMD6Q15008 389 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CAMK4Q16566 473 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKS3Q6ZW76 656 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIML1Q8N9V2 468 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1468Q9P260 1216 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 FNIP2Q9P278 1114 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 DPP7Q9UHL4 492 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 NCOR1O75376 2440 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 C1RP00736 705 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 TNNI1P19237 187 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 NR2F2P24468 414 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PRCPP42785 496 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFV1P49821 464 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 AP3M2P53677 418 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP24A1Q07973 514 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAM9Q13443 819 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP135Q66GS9 1140 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR49Q8IV35 697 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 ADSSL1Q8N142 457 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CASP10Q92851 521 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 SUSD3Q96L08 255 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CLSTN2Q9H4D0 955 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 INTS13Q9NVM9 706 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 ANO9A1A5B4 782 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 H7C4K7 107 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PIRO00625 290 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CETN3O15182 167 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 MAPK13O15264 365 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CNPP09543 421 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 BRCC3P46736 316 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF6P49848 677 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 GUCY2FP51841 1108 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 RBP5P82980 135 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 MORC3Q14149 939 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMD5Q16401 504 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CENPPQ6IPU0 288 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF560Q96MR9 790 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP62CLQ9H1M0 184 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.62■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 BICDL2A1A5D9 508 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 M0QZQ0 153 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 BIN1O00499 593 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX28O15482 410 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 MBD3O95983 291 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT13P13646 458 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 COL9A1P20849 921 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNA5P22460 613 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 LILRA4P59901 499 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC63Q05C16 580 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 SV2CQ496J9 727 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 RTP2Q5QGT7 225 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 ISM2Q6H9L7 571 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC52Q8N7C0 313 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 TMC2Q8TDI7 906 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 B3GALT6Q96L58 329 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 CGRRF1Q99675 332 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 DSEQ9UL01 958 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM50BQ9Y247 325 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 BACE2Q9Y5Z0 518 aa16.61■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 I3L4J1 428 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms