RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367760.7

PRRX1-202, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-202ENST00000367760 PSTPIP1O43586 416 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 LIG3P49916 1009 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 NOMO3P69849 1222 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 SGO2Q562F6 1265 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 TMEM270Q6UE05 265 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 GADL1Q6ZQY3 521 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC91Q7Z6B0 441 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 GRK7Q8WTQ7 553 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 KAT2BQ92831 832 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 CYFIP2Q96F07 1278 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.08■□□□□ 0.49
PRRX1-202ENST00000367760 CXCL11O14625 94 aa18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 PTGISQ16647 500 aa18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ODF2Q5BJF6 829 aa18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 SPOPLQ6IQ16 392 aa18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 SULF1Q8IWU6 871 aa18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ART4Q93070 314 aa18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ADAM22Q9P0K1 906 aa18.08■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 LGR5O75473 907 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 HPDP32754 393 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 PPP2R2AP63151 447 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 GUCY1A3Q02108 690 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 CALCOCO2Q13137 446 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 PPP1R7Q15435 360 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 CPNE8Q86YQ8 564 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 C3orf20Q8ND61 904 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 WHRNQ9P202 907 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 LRRC37A2A6NM11 1700 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 SKIDA1Q1XH10 827 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 RHOT1Q8IXI2 618 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 FAM84AQ96KN4 292 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 NUB1Q9Y5A7 615 aa18.07■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 OGTO15294 1046 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 MSCO60682 206 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 LSM8O95777 96 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 RARGP13631 454 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF132P52740 706 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ERO1BQ86YB8 467 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 OR5B17Q8NGF7 314 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 TLCD1Q96CP7 247 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 PGM2Q96G03 612 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 TMEM109Q9BVC6 243 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 PARVAQ9NVD7 372 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 THAP12O43422 761 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 GAS8O95995 478 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ASS1P00966 412 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 CALCAP01258 141 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 SLC26A2P50443 739 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 MAPK6Q16659 721 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 UBR7Q8N806 425 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 EPB41L4BQ9H329 900 aa18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 OTOFQ9HC10 1997 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 NOP56O00567 594 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 FAM189A1O60320 539 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 EDN1P05305 212 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ITIH2P19823 946 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 CETN2P41208 172 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 GSCP56915 257 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 CAV1Q03135 178 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 MCL1Q07820 350 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ADCY2Q08462 1091 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 MAMLD1Q13495 774 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 KATNAL2Q8IYT4 538 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 CNPY4Q8N129 248 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 GPR20Q99678 358 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 C11orf70Q9BRQ4 267 aa18.05■□□□□ 0.48
PRRX1-202ENST00000367760 TCHPQ9BT92 498 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms