RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 AGAP1Q9UPQ3 857 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 ALPK3Q96L96 1907 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 F8VZ95 297 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 EOMESO95936 686 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 JAM2P57087 298 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 RBP5P82980 135 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 MYO6Q9UM54 1294 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 NUB1Q9Y5A7 615 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA4-201ENST00000360046 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 SCNN1GP51170 649 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 FAM189BP81408 668 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 GCNT1Q02742 428 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ARID5AQ03989 594 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM139Q8IV31 216 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 CXorf38Q8TB03 319 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 KREMEN1Q96MU8 473 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 THP07101 528 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 SYN1P17600 705 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 STAT1P42224 750 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 IKBKEQ14164 716 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 TAF4BQ92750 862 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 FAM81BQ96LP2 452 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ARID3AQ99856 593 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 XYLT2Q9H1B5 865 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ACRP10323 421 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ATICP31939 592 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ASIC2Q16515 512 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 MEA1Q16626 185 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 WDR59Q6PJI9 974 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 BADQ92934 168 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 HPDLQ96IR7 371 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 GPR88Q9GZN0 384 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 GFPT2O94808 682 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 POMCP01189 267 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 CYP3A5P20815 502 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 SOX5P35711 763 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 USP8P40818 1118 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 CUL2Q13617 745 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 MIOSQ9NXC5 875 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 SCN1AP35498 2009 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 FGFR1P11362 822 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 FECHP22830 423 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 MYO1EQ12965 1108 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 C9orf57Q5W0N0 161 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 VWCEQ96DN2 955 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 CHP1Q99653 195 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 SOWAHDA6NJG2 315 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 PPEF2O14830 753 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 OFD1O75665 1012 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 SHC3Q92529 594 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 TTC3P53804 2025 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 FERP16591 822 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 FPGSQ05932 587 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 GRIK3Q13003 919 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC52Q8N7C0 313 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 IL23AQ9NPF7 189 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 POLIQ9UNA4 740 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ANO9A1A5B4 782 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGAP6O43182 974 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 KRT5P13647 590 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 P4HA1P13674 534 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms