RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 MYBPC3Q14896 1274 aa17.83■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 NCAPG2Q86XI2 1143 aa17.83■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SNF8Q96H20 258 aa17.83■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 C9orf72Q96LT7 481 aa17.83■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SPATA16Q9BXB7 569 aa17.83■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 ATXN10Q9UBB4 475 aa17.83■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 FTLP02792 175 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 LYNP07948 512 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 NEK3P51956 506 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SLC12A3P55017 1021 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 UBXN2AP68543 259 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CTC1Q2NKJ3 1217 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SLC45A4Q5BKX6 768 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SLFN12Q8IYM2 578 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 LENG9Q96B70 501 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 GLT8D2Q9H1C3 349 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 LRRC19Q9H756 370 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 PREBQ9HCU5 417 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 KRT82Q9NSB4 513 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CLDN3O15551 220 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 EXOC3O60645 756 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 RPL13P26373 211 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 ZNF76P36508 570 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 HS2ST1Q7LGA3 356 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CFAP61Q8NHU2 1237 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 IKZF4Q9H2S9 585 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 NPHS2Q9NP85 383 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 EURLQ9NYK6 297 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SERPINA10Q9UK55 444 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 PLSCR1O15162 318 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SPOPO43791 374 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 RSPH10BP0C881 870 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 ETS2P15036 469 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 MUTP22033 750 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CYP3A7P24462 503 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 IVDP26440 423 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 AP3B2Q13367 1082 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 PDK4Q16654 411 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 WDR72Q3MJ13 1102 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SGO2Q562F6 1265 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 WDR60Q8WVS4 1066 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 ATG4AQ8WYN0 398 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 MAML1Q92585 1016 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 STMN2Q93045 179 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 REEP2Q9BRK0 252 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SAR1AQ9NR31 198 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 WASF2Q9Y6W5 498 aa17.82■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 FRMPD4Q14CM0 1322 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 YDJCA8MPS7 323 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CCDC22O60826 627 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 RGS9BPQ6ZS82 235 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 OTOAQ7RTW8 1153 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 ACER1Q8TDN7 264 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 DENND1AQ8TEH3 1009 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CRYGNQ8WXF5 182 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 NCSTNQ92542 709 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CD101Q93033 1021 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 BTBD6Q96KE9 485 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 WNT8AQ9H1J5 351 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 GALNT8Q9NY28 637 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 MSH4O15457 936 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 COQ9O75208 318 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SPDYAQ5MJ70 313 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 AGPAT1Q99943 283 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 BTBD10Q9BSF8 475 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SYNCQ9H7C4 482 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 PRR12Q9ULL5 1215 aa17.81■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 C2CD2LO14523 706 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 GSC2O15499 205 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CFBP00751 764 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 GSTA3Q16772 222 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CCDC174Q6PII3 467 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 TRABD2AQ86V40 505 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 C4orf33Q8N1A6 199 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 MBOAT7Q96N66 472 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CCDC77Q9BR77 488 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CHST7Q9NS84 486 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 ANAPC5Q9UJX4 755 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 DNM3Q9UQ16 869 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 SFI1A8K8P3 1242 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 CHMP2AO43633 222 aa17.8■□□□□ 0.44
GDE1-201ENST00000353258 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms