RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 VMP1Q96GC9 406 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MYO6Q9UM54 1294 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 USP27XA6NNY8 438 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 KBTBD13C9JR72 458 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 LRRN2O75325 713 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 IL18RAPO95256 599 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 NPTXRO95502 500 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CLTAP09496 248 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RFX1P22670 979 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 AP3M2P53677 418 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MGAT3Q09327 533 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PTK7Q13308 1070 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TOMM20Q15388 145 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 NOTUMQ6P988 496 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FAM84AQ96KN4 292 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RAB20Q9NX57 234 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PHF24Q9UPV7 400 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 VNN1O95497 513 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CXCL8P10145 99 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 IL4RP24394 825 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ASIC2Q16515 512 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ZACNQ401N2 412 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 HOOK3Q86VS8 718 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SPAG5Q96R06 1193 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SH3GL3Q99963 347 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CHRNA1P02708 482 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CCL5P13501 91 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 GRM5P41594 1212 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PIK3CAP42336 1068 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RWDD2BP57060 319 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FAM228AQ86W67 206 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 STK33Q9BYT3 514 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 GPR88Q9GZN0 384 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 LACTBL1A8MY62 500 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 F8VZ95 297 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 AP1G2O75843 785 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 HLA-DRAP01903 254 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SERPING1P05155 500 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CTSHP09668 335 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MYBL2P10244 700 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 THPOP40225 353 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 BIRC3Q13489 604 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MTFR1Q15390 333 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 HGSNATQ68CP4 663 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FLCNQ8NFG4 579 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FAM81BQ96LP2 452 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ACAP3Q96P50 834 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DESI2Q9BSY9 194 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DNM1LO00429 736 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN12O43309 604 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 B4GALT4O60513 344 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 NDUFA10O95299 355 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 STAT1P42224 750 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RANBP1P43487 201 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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