RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 NOMO3P69849 1222 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC14Q15048 493 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 OSBPL8Q9BZF1 889 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 CNTN6Q9UQ52 1028 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ZBED4O75132 1171 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ATP6V1G2O95670 118 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 BRAFP15056 766 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 KCNA2P16389 499 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 KLRC2P26717 231 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 SOX10P56693 466 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 MCM8Q9UJA3 840 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 SCINQ9Y6U3 715 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 PARP14Q460N5 1801 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 MPP2Q14168 576 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 NEDD9Q14511 834 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF365Q70YC5 407 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 BICD1Q96G01 975 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 IFT74Q96LB3 600 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 VPS33BQ9H267 617 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD1-201ENST00000331462 UBOX5O94941 541 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 PSAPP07602 524 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 DSG3P32926 999 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 TAS2R40P59535 323 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 MAMLD1Q13495 774 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 MGARPQ8TDB4 240 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 SIP14410 1827 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 PIGRP01833 764 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3CAP42336 1068 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 NCALDP61601 193 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CUL2Q13617 745 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 IZUMO3Q5VZ72 239 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 NUGGCQ68CJ6 796 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA21Q7Z572 469 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CCHCR1Q8TD31 782 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 MAGEB18Q96M61 343 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC77Q9BR77 488 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 AGAP1Q9UPQ3 857 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 WNT10BO00744 389 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 NR3C2P08235 984 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 LMNB2Q03252 620 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 BNIP1Q12981 228 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CYP4X1Q8N118 509 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 FNBP1Q96RU3 617 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 NOD2Q9HC29 1040 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ADAM22Q9P0K1 906 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 VWA5AO00534 786 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 VNN1O95497 513 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CETPP11597 493 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 LIG4P49917 911 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 FAM84AQ96KN4 292 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 C11orf70Q9BRQ4 267 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 HEMGNQ9BXL5 484 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 RNF146Q9NTX7 359 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 PRKCEQ02156 737 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 TEPSINQ96N21 525 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 EZRP15311 586 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 WNT7BP56706 349 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 STRN3Q13033 797 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 NR1H3Q13133 447 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 DGKZQ13574 1117 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 TDRPQ86YL5 185 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 PWWP2AQ96N64 755 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms