RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
RNPS1-201ENST00000301730 PPEF2O14830 753 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 CLIC2O15247 247 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 MCM4P33991 863 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 PDXDC1Q6P996 788 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 SUSD3Q96L08 255 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 SYN3O14994 580 aa22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.178e-6■■■■■ 52.4
RNPS1-201ENST00000301730 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 S1PR5Q9H228 398 aa22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 MTRRQ9UBK8 725 aa22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 FAM50BQ9Y247 325 aa22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 C5orf42Q9H799 3197 aa22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 SCN1AP35498 2009 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 ANO9A1A5B4 782 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF233A6NK53 670 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 GLUD1P00367 558 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 CYP2J2P51589 502 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 DPP3Q9NY33 737 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 PIRO00625 290 aa22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 C1RP00736 705 aa22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 PALB2Q86YC2 1186 aa22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 APOL5Q9BWW9 433 aa22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 M0QZQ0 153 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 PDXKO00764 312 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 ADAM12O43184 909 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 TGM5O43548 720 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 KINO60870 393 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 LILRA4P59901 499 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 LILRA6Q6PI73 481 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 SPATA20Q8TB22 786 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 SUSD6Q92537 303 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 SPTLC1O15269 473 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 KIF20AO95235 890 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 UBE2HP62256 183 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 RDH13Q8NBN7 331 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 FAM84AQ96KN4 292 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 GSDMAQ96QA5 445 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 RMND1Q9NWS8 449 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 MUC3AQ02505 3323 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 TSC2P49815 1807 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 PTPRJQ12913 1337 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 TBC1D4O60343 1298 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 PAX3P23760 479 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 OR1D2P34982 312 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 ITIH3Q06033 890 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 RAB33AQ14088 237 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 SURF1Q15526 300 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 APPL2Q8NEU8 664 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 DMAC2Q9NW81 257 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 DPP7Q9UHL4 492 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 CDH22Q9UJ99 828 aa22.33■■□□□ 1.17
RNPS1-201ENST00000301730 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms