RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 AK8Q96MA6 479 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 REEP2Q9BRK0 252 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 TTC26A0AVF1 554 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 SLC26A4O43511 780 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 UBA7P41226 1012 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 TNFSF9P41273 254 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 LIG4P49917 911 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ADCY1Q08828 1119 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 GPBP1Q86WP2 473 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 TCEAL4Q96EI5 215 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 KIF12Q96FN5 646 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 CALML4Q96GE6 196 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF197O14709 1029 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 SP9P0CG40 484 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 CPB1P15086 417 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 CD72P21854 359 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 LRPAP1P30533 357 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB6Q15916 424 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 TANGO2Q6ICL3 276 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ELMOD1Q8N336 334 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC15Q8TF66 581 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 KCNN1Q92952 543 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ELSPBP1Q96BH3 223 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 BCO2Q9BYV7 579 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 CFAP54Q96N23 3096 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 FAM170BA6NMN3 283 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 M0QZQ0 153 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 FAM13AO94988 1023 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 CYP3A5P20815 502 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 CCR2P41597 374 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 MCM2P49736 904 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 TWF1Q12792 350 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 KYAT1Q16773 422 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 IQCEQ6IPM2 695 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 MYCT1Q8N699 235 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 CEP72Q9P209 647 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 MAFFQ9ULX9 164 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 TBX20Q9UMR3 447 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 LACTBL1A8MY62 500 aa21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 K7ENM7 598 aa21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 MICAL2O94851 1124 aa21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 FCARP24071 287 aa21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 TPRG1Q6ZUI0 275 aa21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 OGTO15294 1046 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 XPOTO43592 962 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 TRAK2O60296 914 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 FAM189A1O60320 539 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 OAZ2O95190 189 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 PIGRP01833 764 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 PLCG1P19174 1290 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 SCP2P22307 547 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 GUCY2FP51841 1108 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF131P52739 623 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 GRIN1Q05586 938 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 MCM6Q14566 821 aa21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms