RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 LPAR1Q92633 364 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 C11orf70Q9BRQ4 267 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 HEMGNQ9BXL5 484 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 YY1AP1Q9H869 796 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM8AQ9HCN3 771 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 GABBR1Q9UBS5 961 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 PLIN4Q96Q06 1357 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 FNTAP49354 379 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TAF11Q15544 211 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 CYFIP1Q7L576 1253 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 GIPC2Q8TF65 315 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 BRAFP15056 766 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TMED1Q13445 227 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TTMPQ5BVD1 217 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 STYK1Q6J9G0 422 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 OTOP1Q7RTM1 612 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 CYP2W1Q8TAV3 490 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 USP6NLQ92738 828 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 OTUD5Q96G74 571 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 DACH2Q96NX9 599 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 RNF146Q9NTX7 359 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TMX2Q9Y320 296 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 FRMPD4Q14CM0 1322 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 NVLO15381 856 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TLR2O60603 784 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SLITRK3O94933 977 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 ITGA4P13612 1032 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 BLVRAP53004 296 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 RAD51Q06609 339 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 BMT2Q1RMZ1 405 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 CENPUQ71F23 418 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 PGBD3Q8N328 593 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 MRIQ9BWK5 157 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 ANKEF1Q9NU02 776 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM247A6NEH6 219 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 PHF20L1A8MW92 1017 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 KRT8P05787 483 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 KRT4P19013 534 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 CASP2P42575 452 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 E2F5Q15329 346 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SLC35G1Q2M3R5 365 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 C11orf63Q6NUN7 778 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 MCUQ8NE86 351 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TEX12Q9BXU0 123 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 HACL1Q9UJ83 578 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 COILP38432 576 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 HUNKP57058 714 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 ADCY1Q08828 1119 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SLC29A2Q14542 456 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 GRAMD4Q6IC98 578 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM270Q6UE05 265 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TRIML2Q8N7C3 387 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM35BQ8NCS4 154 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 ETNPPLQ8TBG4 499 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TIAM2Q8IVF5 1701 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 MYH6P13533 1939 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TJP1Q07157 1748 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 CFAP73A6NFT4 308 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 EML1O00423 815 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 CLDN3O15551 220 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 NOL4O94818 638 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 CALB1P05937 261 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 ARP10275 920 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TSPY1Q01534 308 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TTLL4Q14679 1199 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 CERS5Q8N5B7 392 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 ACER1Q8TDN7 264 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SLC5A5Q92911 643 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TRAIPQ9BWF2 469 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 DGAT1O75907 488 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 ATG16L1Q676U5 607 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 PITPNM3Q9BZ71 974 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SAYSD1Q9NPB0 183 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 KCNQ5Q9NR82 932 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 MYH3P11055 1940 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 RASA4BC9J798 803 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms