RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.12
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CCDC42-201ENST00000293845 FAM84AQ96KN4 292 aa14.29□□□□□ -0.12
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CCDC42-201ENST00000293845 CDH23Q9H251 3354 aa14.28□□□□□ -0.12
CCDC42-201ENST00000293845 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.12
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CCDC42-201ENST00000293845 GRM6O15303 877 aa14.27□□□□□ -0.12
CCDC42-201ENST00000293845 PMM2O15305 246 aa14.27□□□□□ -0.12
CCDC42-201ENST00000293845 LPXNO60711 386 aa14.27□□□□□ -0.12
CCDC42-201ENST00000293845 TADA2AO75478 443 aa14.27□□□□□ -0.12
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CCDC42-201ENST00000293845 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
CCDC42-201ENST00000293845 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
CCDC42-201ENST00000293845 GCLMP48507 274 aa14.27□□□□□ -0.12
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CCDC42-201ENST00000293845 LILRA4P59901 499 aa14.27□□□□□ -0.12
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CCDC42-201ENST00000293845 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.27□□□□□ -0.12
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CCDC42-201ENST00000293845 KRT19P08727 400 aa14.26□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF18P17022 549 aa14.26□□□□□ -0.13
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CCDC42-201ENST00000293845 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.26□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.26□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 GPR65Q8IYL9 337 aa14.26□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.26□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 SUSD3Q96L08 255 aa14.26□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.26□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 ZBP1Q9H171 429 aa14.26□□□□□ -0.13
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CCDC42-201ENST00000293845 FANCLQ9NW38 375 aa14.26□□□□□ -0.13
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CCDC42-201ENST00000293845 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.26□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.26□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 TRANK1O15050 2925 aa14.26□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 KCNJ18B7U540 433 aa14.25□□□□□ -0.13
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CCDC42-201ENST00000293845 SYN3O14994 580 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 SPTLC1O15269 473 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 P4HA2O15460 535 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 PHACTR2O75167 634 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 VNN1O95497 513 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJB1P25685 340 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 ATICP31939 592 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 BRCC3P46736 316 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 FMO5P49326 533 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 KCNH2Q12809 1159 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 NCOA4Q13772 614 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC42-201ENST00000293845 KCNJ12Q14500 433 aa14.25□□□□□ -0.13
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