RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA6Q8N139 1617 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ANGPT2O15123 496 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 NR3C2P08235 984 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SULT1E1P49888 294 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ELMOD1Q8N336 334 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 AGR3Q8TD06 166 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MAFGO15525 162 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL2O95198 593 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 KYNUQ16719 465 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 RFX8Q6ZV50 586 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 LONP2Q86WA8 852 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 GANCQ8TET4 914 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ERP27Q96DN0 273 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 IL17RAQ96F46 866 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.2■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF197O14709 1029 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CAMTA2O94983 1202 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 RMDN1Q96DB5 314 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 OTUD5Q96G74 571 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 EHD2Q9NZN4 543 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 GFAPP14136 432 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CCND1P24385 295 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MED21Q13503 144 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf22Q6V702 233 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 IL25Q9H293 177 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DRAP01903 254 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CNGA3Q16281 694 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SZRD1Q7Z422 152 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 VCPKMTQ9H867 229 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SLC24A3Q9HC58 644 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 KCNQ2O43526 872 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PTK7Q13308 1070 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 POLIQ9UNA4 740 aa22.19■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MTMR2Q13614 643 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 EMC2Q15006 297 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 DACH2Q96NX9 599 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 IL18RAPO95256 599 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 APPL2Q8NEU8 664 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 KCNB2Q92953 911 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CCT8L1PA6NM43 557 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf81C9J6K1 198 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 POTEAQ6S8J7 498 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MAN1A2O60476 641 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 FNTAP49354 379 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 KLK7P49862 253 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 LAMB3Q13751 1172 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa22.18■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA8P53708 1063 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PTPAQ15257 358 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 RBBP7Q16576 425 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC7Q99615 494 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 NEMP1O14524 444 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEB2O15479 319 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 KLC1Q07866 573 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 TROAPQ12815 778 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 FLOT2Q14254 428 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 PTGISQ16647 500 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCSAP-201ENST00000284617 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms