RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 ANO3Q9BYT9 981 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 P2RX5Q93086 422 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 DYDC2Q96IM9 177 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 STRNO43815 780 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ADRM1Q16186 407 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ECM1Q16610 540 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 DLK2Q6UY11 383 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 KCNK18Q7Z418 384 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 FBXO11Q86XK2 927 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CALML4Q96GE6 196 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 TCHPQ9BT92 498 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 SYNCQ9H7C4 482 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CPA3P15088 417 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 NEK3P51956 506 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 VWA3BQ502W6 1294 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 RFWD3Q6PCD5 774 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 METTL13Q8N6R0 699 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 TMX2Q9Y320 296 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 POTEFA5A3E0 1075 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 POTEIP0CG38 1075 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CDK4P11802 303 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 GALK1P51570 392 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ACSBG2Q5FVE4 666 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 TRIM51Q9BSJ1 452 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 RPTORQ8N122 1335 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 SERPING1P05155 500 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PYGMP11217 842 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ASIC1P78348 528 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 GAB3Q8WWW8 586 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 HPS3Q969F9 1004 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 SNX27Q96L92 541 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 KANSL1LA0AUZ9 987 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.35e-12■■■■■ 44.4
PITX1-201ENST00000265340 KRT38O76015 456 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 FCER1AP12319 257 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K10Q02779 954 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 STK4Q13043 487 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 ERP44Q9BS26 406 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 STARD13Q9Y3M8 1113 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 ZNF711Q9Y462 761 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 SLCO1A2P46721 670 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 DRG2P55039 364 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 BCL2A1Q16548 175 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 SLC18A3Q16572 532 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 DSTYKQ6XUX3 929 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 DAAM2Q86T65 1068 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 FAM83AQ86UY5 434 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 MYMKA6NI61 221 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 ATP5DP30049 168 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 PDE4DQ08499 809 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 ZNF449Q6P9G9 518 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 FNDC8Q8TC99 324 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 PITPNM3Q9BZ71 974 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 LSM1O15116 133 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 ACADVLP49748 655 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 CDR2Q01850 454 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX1-201ENST00000265340 DSG1Q02413 1049 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms