RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Runx2Q08775 607 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Msantd2Q6NZR2 559 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btbd9Q8C726 612 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 N4bp3Q8C7U1 537 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abhd8Q8R0P8 439 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl36Q8R124 613 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q8R1Y2 203 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1499Q8VG65 314 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcp11x2A2AEI7 503 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp35M0QWN7 1009 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rit2P70425 217 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tgfbrap1Q3UR70 860 aa17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsta4P24472 222 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spink5Q148R4 1017 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf10Q3UIW5 804 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sun2Q8BJS4 731 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt90E9Q1Z0 538 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lzts1P60853 599 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TchpQ3TVW5 497 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klra7Q60654 280 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Inpp4bQ6P1Y8 924 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcns3Q8BQZ8 491 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MgarpQ8VI64 283 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Med10Q9CXU0 135 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AuhQ9JLZ3 314 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13084A2A8N0 494 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bfsp1A2AMT1 669 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Unc5cO08747 931 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tp53P02340 387 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gja8P28236 440 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SftpbP50405 377 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcf4Q60722 670 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc117Q6PB51 277 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dzip3Q7TPV2 1204 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugt3a2Q8JZZ0 523 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf445Q8R2V3 986 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sgk1Q9WVC6 431 aa16.99■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc13D3YV10 709 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Magea1O89006 320 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Magea5O89009 320 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrlP06879 226 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbc1d10aP58802 500 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plk4Q64702 925 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Srd5a1Q68FF9 255 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Magea2Q9R2A2 320 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl41A2AUC9 606 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glt1d1A4FUP9 346 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21973F6WEZ7 68 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tspyl1O88852 379 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sar1aP36536 198 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smg5Q6ZPY2 1017 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tph2Q8CGV2 488 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc12a8Q8VI23 705 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdha10Q91Y20 946 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cst12Q9DAN8 128 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2-OaQ9QWV1 250 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aldh18a1Q9Z110 795 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fem1bQ9Z2G0 627 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnn2P58390 839 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psmc5P62196 406 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SbdsP70122 250 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kmt5aQ2YDW7 349 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp120Q8BZW4 436 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q99KU6 348 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tex9Q9D845 387 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adrm1Q9JKV1 407 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa16.98■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm15448F6PZL4 682 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ripk2P58801 539 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Raver2Q7TPD6 673 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf879Q8BI99 563 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col23a1Q8K4G2 532 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HlcsQ920N2 722 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdzd4Q9QY39 772 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif9Q9WV04 790 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr95D3Z7A8 784 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc17E9PVB5 1198 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 S100a5P63084 93 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Upf3bQ3ULL6 472 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dsg1aQ61495 1057 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klra3Q64329 266 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ece2Q80Z60 881 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cabs1Q8C633 391 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DolkQ8R2Y3 534 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf6Q9DBU5 667 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4846B2RWH8 538 aa16.97■□□□□ 0.31
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Akr1b8P45377 316 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.5 ms