RNA–Protein interactions for RNA: YFL004W

VTC2, Transcript of Subunit of vacuolar transporter chaperone (VTC) complex, yeast

Gene VTC2, Length 2,487 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VTC2	YFL004W	SYM1	Q06563	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YCT1	Q12235	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	FRE7	Q12333	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
VTC2	YFL004W	TRX3	P25372	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	TKL2	P33315	681 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	DUT1	P33317	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PHO11	P35842	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PHO12	P38693	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YEL068C	P39977	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YGL204C	P53089	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	HST3	P53687	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	TMN2	Q04562	672 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	AGP1	P25376	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YPT53	P36019	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	SDS24	P38314	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	SLM6	P38343	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PFS1	P38872	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MNL1	P38888	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YEA4	P40004	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	HEM14	P40012	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	JHD1	P40034	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PIC2	P40035	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ERV2	Q12284	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YBR292C	P38357	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	FLO5	P38894	1075 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YJL068C	P40363	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	NIT1	P40447	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CTF19	Q02732	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	RCE1	Q03530	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	HUT1	Q12520	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CSE2	P33308	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MIX23	P38162	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	FIG1	P38224	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	HSP10	P38910	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	HHT1	P61830	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	NRG1	Q03125	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CCE1	Q03702	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	RSF1	Q05043	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	SRF1	Q12516	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	IMG1	P25626	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YGR126W	P53274	230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	HRD1	Q08109	551 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	RPB5	P20434	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YKL187C	P34231	750 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YKL102C	P34249	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	DOG1	P38774	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	NEO1	P40527	1151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YAR1	P46683	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CAB5	Q03941	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	FSH2	Q05015	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	GEX2	P36173	615 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	INM1	P38710	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YHL044W	P38727	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PAC2	P39937	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	GIM5	Q04493	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CNL1	Q06333	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
VTC2	YFL004W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PRR2	Q12310	699 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ORT1	Q12375	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	DSS4	P32601	143 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	SFH5	P47008	294 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	TOS2	P50078	622 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	EMC4	P53073	190 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	PAU4	P53427	120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	RNH201	P53942	307 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	INP1	Q03694	420 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	SUL2	Q12325	893 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	CCH1	P50077	2039 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VTC2	YFL004W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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