RNA–Protein interactions for RNA: YEL065W

SIT1, Transcript of Ferrioxamine B transporter, yeast

Gene SIT1, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIT1	YEL065W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	FMP23	P38231	175 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	YHL049C	P38722	271 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	DOG2	P38773	246 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	DOG1	P38774	246 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	FLC3	P53121	802 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	TPC1	P53257	314 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	YNL046W	P53956	172 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	MRX11	Q03079	207 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SIT1	YEL065W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	UGX2	P32772	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	APS1	P35181	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YKR073C	P36153	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YBR285W	P38354	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	TRR2	P38816	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	SPL2	P38839	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PEX22	P39718	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PEX17	P40155	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	XBP1	P40489	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	CRZ1	P53968	678 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	RAV2	Q03956	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	FAR10	Q06001	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	LDB18	Q07887	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PCL9	Q12477	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	HEM4	P06174	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	AHC2	P25649	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	GPX1	P36014	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	MBA1	P38300	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	ARN2	P38724	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PLP1	Q04004	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	MRPL39	P36533	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	MAM33	P40513	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	FAR7	P43592	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PHO23	P50947	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	NRM1	P53718	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	MSA1	Q08471	629 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PDR11	P40550	1411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YCR022C	P25620	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	SOL2	P37262	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	CHL4	P38907	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	HEM14	P40012	539 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YJR015W	P47090	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	BSP1	Q06604	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	HRD1	Q08109	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	AIM39	Q08223	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	CDC50	P25656	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	HAC1	P41546	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YNL234W	P53857	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	MIM1	Q08176	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	MDM32	Q12171	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	FYV7	Q12247	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	TFC1	P32367	649 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	TRS65	P32893	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PMU1	P36069	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	COX14	P39103	70 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	ECL1	P48235	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	MRH4	P53166	561 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	DID2	P69771	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	SDH7	Q04401	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	SHH4	Q06236	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	LCB3	P47013	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	FMN1	Q03778	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	TRM12	Q04235	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	SUE1	Q06524	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	OSW1	Q08692	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	PEX34	P25584	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIT1	YEL065W	FUN26	P31381	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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