RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 GLRA2P23416 452 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 CCNE1P24864 410 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 NTRK3Q16288 839 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 INF2Q27J81 1249 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 NEK8Q86SG6 692 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF461Q8TAF7 563 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 DYDC2Q96IM9 177 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 GPR88Q9GZN0 384 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.53□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.53□□□□□ -0.88
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HLA-B-257ENST00000640094 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.53□□□□□ -0.88
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HLA-B-257ENST00000640094 H7C4K7 107 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 CPLX1O14810 134 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 TM4SF5O14894 197 aa9.52□□□□□ -0.89
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HLA-B-257ENST00000640094 IGF2RP11717 2491 aa9.52□□□□□ -0.89
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HLA-B-257ENST00000640094 MPLP40238 635 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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HLA-B-257ENST00000640094 NAB2Q15742 525 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 MAPK6Q16659 721 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 FAM187BQ17R55 369 aa9.52□□□□□ -0.89
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HLA-B-257ENST00000640094 TPGS2Q68CL5 300 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 RNF43Q68DV7 783 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 Q6ZS52 159 aa9.52□□□□□ -0.89
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HLA-B-257ENST00000640094 TPH2Q8IWU9 490 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 FBXL16Q8N461 479 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.52□□□□□ -0.89
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HLA-B-257ENST00000640094 RGL1Q9NZL6 768 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 MAFFQ9ULX9 164 aa9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.51□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 NUP205Q92621 2012 aa9.51□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.51□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 SOBPA7XYQ1 873 aa9.51□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 M0R2N6 131 aa9.51□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 ARNTLO00327 626 aa9.51□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 SYN3O14994 580 aa9.51□□□□□ -0.89
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HLA-B-257ENST00000640094 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.5□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.5□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 C1QTNF9P0C862 333 aa9.5□□□□□ -0.89
HLA-B-257ENST00000640094 MYL4P12829 197 aa9.5□□□□□ -0.89
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