RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636870.1

CNTNAP2-215, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 4,010 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-215	ENST00000636870	FAM210A	Q96ND0	272 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ACAP3	Q96P50	834 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	PDP2	Q9P2J9	529 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	SUN2	Q9UH99	717 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870		A0A087X0T9	212 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	USP17L5	A8MUK1	530 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	UBOX5	O94941	541 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	FAM228B	P0C875	321 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	PRLR	P16471	622 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	COPB2	P35606	906 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	NT5C2	P49902	561 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ANTXR2	P58335	489 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	OSTN	P61366	133 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	AGPAT1	Q99943	283 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	PALMD	Q9NP74	551 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ALG6	Q9Y672	507 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CNTNAP2-215	ENST00000636870	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870		H3BRJ5	948 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	FOXP2	O15409	715 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	DAB2	P98082	770 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	CXCL9	Q07325	125 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	LAMB3	Q13751	1172 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	PTPA	Q15257	358 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	SP8	Q8IXZ3	490 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	EME1	Q96AY2	570 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	TRIM15	Q9C019	465 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	HAO1	Q9UJM8	370 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		7.34	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	EMSY	Q7Z589	1322 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870		A0A1W2PQJ5	194 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	MAP2K7	O14733	419 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ECE2	O60344	883 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	KRT34	O76011	436 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	GDF11	O95390	407 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	GLI1	P08151	1106 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	NEK2	P51955	445 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	MTM1	Q13496	603 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	MTERF2	Q49AM1	385 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	KLC3	Q6P597	504 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	FAM20A	Q96MK3	541 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	HPSE	Q9Y251	543 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	USP54	Q70EL1	1684 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	PDXK	O00764	312 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	CYP26A1	O43174	497 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ANXA13	P27216	316 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	P3H1	Q32P28	736 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	RSPH3	Q86UC2	560 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	MICALL2	Q8IY33	904 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	KCNK16	Q96T55	309 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	DNAJC7	Q99615	494 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	STK33	Q9BYT3	514 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	CARD9	Q9H257	536 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	SENP2	Q9HC62	589 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CNTNAP2-215	ENST00000636870	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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