RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	KRT17	Q04695	432 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	STXBP2	Q15833	593 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	NFASC	O94856	1347 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	OAT	P04181	439 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT17	P0C025	328 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	OAZ1	P54368	228 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	RTP1	P59025	263 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	PSMD6	Q15008	389 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC114	Q96M63	670 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	GGA3	Q9NZ52	723 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ACSL3	O95573	720 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	DRP2	Q13474	957 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC38	Q502W7	563 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	GNA15	P30679	374 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	TLCD1	Q96CP7	247 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	PORCN	Q9H237	461 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	FSCN2	O14926	492 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RIPK2	O43353	540 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	FNTA	P49354	379 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CUL2	Q13617	745 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ART4	Q93070	314 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PWWP2A	Q96N64	755 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC19	Q9H756	370 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152		H0YCG3	227 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	THAP12	O43422	761 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RALA	P11233	206 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CHN1	P15882	459 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MARK3	P27448	753 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CHKA	P35790	457 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TNFSF9	P41273	254 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	LONRF1	Q17RB8	773 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RARG	P13631	454 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CD58	P19256	250 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	NAMPT	P43490	491 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R40	P59535	323 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	BPIFB4	P59827	614 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CENPC	Q03188	943 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	KAT2B	Q92831	832 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152		H0YHG0	523 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	FZD9	O00144	591 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TP73	O15350	636 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN10	P78369	228 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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