RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.27■■□□□ 1.32
SGMS1-210ENST00000619438 RCCD1A6NED2 376 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 HOXA2O43364 376 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 EOMESO95936 686 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 NR3C1P04150 777 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 SKIP12755 728 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 CTNNB1P35222 781 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 HGSNATQ68CP4 663 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 IFT74Q96LB3 600 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 FIZ1Q96SL8 496 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 FAM53CQ9NYF3 392 aa23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 PJA2O43164 708 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 MYCT1Q8N699 235 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 KIFAP3Q92845 792 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 TGFB1I1O43294 461 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 SERPING1P05155 500 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 BMPR1AP36894 532 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 CLCN6P51797 869 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 PPP2R5AQ15172 486 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 GANQ9H2C0 597 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.25■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 ARID2Q68CP9 1835 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 AKAP3O75969 853 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 GPM6BQ13491 265 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 TEX35Q5T0J7 233 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 DEPTORQ8TB45 409 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 BORCS6Q96GS4 357 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 STRA6Q9BX79 667 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 DEF6Q9H4E7 631 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF446Q9NWS9 450 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 FBXL5Q9UKA1 691 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.24■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 ATP8B1O43520 1251 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 AKR1B10O60218 316 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 RB1P06400 928 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 AXLP30530 894 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 RAB27AP51159 221 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 CYP27A1Q02318 531 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 VCANP13611 3396 aa23.23■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 H3BNC9 293 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 NAMPTP43490 491 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 NOTUMQ6P988 496 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM58Q8NG06 486 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 PGBD4Q96DM1 585 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 CPB2Q96IY4 423 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 TSPAN1O60635 241 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 LPXNO60711 386 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 ALCAMQ13740 583 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 MYBPC2Q14324 1141 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 AAASQ9NRG9 546 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 DMAC2Q9NW81 257 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.22■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.21■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC169A6NNP5 214 aa23.21■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 SFI1A8K8P3 1242 aa23.21■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R37O75864 691 aa23.21■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 CTAGE8P0CG41 777 aa23.21■■□□□ 1.31
SGMS1-210ENST00000619438 NMT1P30419 496 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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