RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 ANO9A1A5B4 782 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 TEX28O15482 410 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 CSPG5O95196 566 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 GLUD2P49448 558 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 ANKRD54Q6NXT1 300 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 TMEM87AQ8NBN3 555 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 CXorf38Q8TB03 319 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 SPATA20Q8TB22 786 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 C2CD2Q9Y426 696 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 UBE4BO95155 1302 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 C5orf42Q9H799 3197 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 TTC28Q96AY4 2481 aa16.87■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 PODXLO00592 558 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 PIRO00625 290 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 B3GAT3O94766 335 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 RHOBTB3O94955 611 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 LDHAP00338 332 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 PRR29P0C7W0 189 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 PPFIBP1Q86W92 1011 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 POMGNT1Q8WZA1 660 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 B3GALT6Q96L58 329 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 TIGD1Q96MW7 591 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 CLSTN3Q9BQT9 956 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 CD207Q9UJ71 328 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 NCOR1O75376 2440 aa16.86■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 EXTL3O43909 919 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 URODP06132 367 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 IL9P15248 144 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 EPCAMP16422 314 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 SPAG1Q07617 926 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 KCNB1Q14721 858 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 FAM171A1Q5VUB5 890 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 JADE1Q6IE81 842 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 HASPINQ8TF76 798 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 CASP10Q92851 521 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 BORCS6Q96GS4 357 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 SUSD3Q96L08 255 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 TTPALQ9BTX7 342 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 DMAC2Q9NW81 257 aa16.85■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 M0QZQ0 153 aa16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 RPN1P04843 607 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 NFICP08651 508 aa16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 BRCC3P46736 316 aa16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 KANK3Q6NY19 840 aa16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 KIF12Q96FN5 646 aa16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 BACE2Q9Y5Z0 518 aa16.84■□□□□ 0.29
BECN1-211ENST00000589636 SYN3O14994 580 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 TRAPPC3O43617 180 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 IL18RAPO95256 599 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 PAX3P23760 479 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 NDUFV1P49821 464 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 PLXNA3P51805 1871 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 GPD1LQ8N335 351 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 FEZF2Q8TBJ5 459 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 SAAL1Q96ER3 474 aa16.83■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms