RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 PANK2Q9BZ23 570 aa22■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 FBXW11Q9UKB1 542 aa22■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 F13A1P00488 732 aa21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 TNFSF9P41273 254 aa21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 ATL3Q6DD88 541 aa21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 CD302Q8IX05 232 aa21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 STRA6Q9BX79 667 aa21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.99■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 SYN3O14994 580 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 ADAM12O43184 909 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 CUTAO60888 179 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 PPP1R37O75864 691 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 MYBP10242 640 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 CYP3A5P20815 502 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 LRPAP1P30533 357 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 OR1D2P34982 312 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 SIGLEC14Q08ET2 396 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 LACTBL1A8MY62 500 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 I3L4J1 428 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 XPOTO43592 962 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 UVSSAQ2YD98 709 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 RTL10Q7L3V2 364 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 PDILTQ8N807 584 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 STAMQ92783 540 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 KIF12Q96FN5 646 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 SUSD3Q96L08 255 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 CUEDC2Q9H467 287 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 PIDD1Q9HB75 910 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 LIMD1Q9UGP4 676 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.97■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 ANK1P16157 1881 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 DOCK8Q8NF50 2099 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM221A6NGB7 291 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 M0R296 226 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 HOXA9P31269 272 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 POSTNQ15063 836 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 LIN9Q5TKA1 542 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 EXOC7Q9UPT5 735 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 CLUHO75153 1309 aa21.96■■□□□ 1.11
GIPC1-211ENST00000589631 H7C4K7 107 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 TBC1D4O60343 1298 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 IDEP14735 1019 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 SPAG1Q07617 926 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 MTMR3Q13615 1198 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 E2F4Q16254 413 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 ADALQ6DHV7 355 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 TNMDQ9H2S6 317 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 PANK4Q9NVE7 773 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 CFAP45Q9UL16 551 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 TRIOO75962 3097 aa21.95■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 C8AP07357 584 aa21.94■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 MCM4P33991 863 aa21.94■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 ALCAMQ13740 583 aa21.94■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 PKP1Q13835 747 aa21.94■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.94■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GIPC1-211ENST00000589631 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms