RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 HES2Q9Y543 173 aa33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 F8VZ95 297 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ASS1P00966 412 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPING1P05155 500 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 FERP16591 822 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF19Q8IW93 802 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 HELQQ8TDG4 1101 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF12Q96FN5 646 aa33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNE1P15382 129 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX5P35711 763 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 MBTPS1Q14703 1052 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ASIC2Q16515 512 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PARP2Q9UGN5 583 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0U1RQF3 1178 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRN2O75325 713 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGA4P13612 1032 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ATICP31939 592 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKCIP41743 596 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB6Q15916 424 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 CHP1Q99653 195 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 OSBPL7Q9BZF2 842 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 KCND1Q9NSA2 647 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
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CAPNS1-206ENST00000588815 CST3P01034 146 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
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CAPNS1-206ENST00000588815 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf127Q8N9H9 656 aa33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 BEST2Q8NFU1 509 aa33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM84AQ96KN4 292 aa33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 APOL6Q9BWW8 343 aa33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 GIT1Q9Y2X7 761 aa33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SOWAHDA6NJG2 315 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 CCP110O43303 1012 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 AKAP5P24588 427 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 TLE2Q04725 743 aa33.38■■■□□ 2.93
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CAPNS1-206ENST00000588815 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM60Q495X7 471 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 SHC3Q92529 594 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 PGBD4Q96DM1 585 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM2Q99965 735 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 PI4K2AQ9BTU6 479 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR88Q9GZN0 384 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 VRTNQ9H8Y1 702 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 UBN1Q9NPG3 1134 aa33.38■■■□□ 2.93
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CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP44Q17R89 818 aa33.37■■■□□ 2.93
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CAPNS1-206ENST00000588815 RNF39Q9H2S5 420 aa33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 HIPK3Q9H422 1215 aa33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
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CAPNS1-206ENST00000588815 MGEA5O60502 916 aa33.37■■■□□ 2.93
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CAPNS1-206ENST00000588815 SIX4Q9UIU6 781 aa33.37■■■□□ 2.93
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CAPNS1-206ENST00000588815 CXorf38Q8TB03 319 aa33.36■■■□□ 2.93
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CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFA10O95299 355 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT19P08727 400 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM71AQ8IYT1 594 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 NIF3L1Q9GZT8 377 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC38A7Q9NVC3 462 aa33.34■■■□□ 2.93
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