RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 BACH1O14867 736 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 SP4Q02446 784 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 XKR9Q5GH70 373 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP4K3Q8IVH8 894 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO9BQ13459 2157 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 EMSYQ7Z589 1322 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-204ENST00000587718 BUB1O43683 1085 aa27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 LGR5O75473 907 aa27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 IKBKEQ14164 716 aa27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 USP37Q86T82 979 aa27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 LMO3Q8TAP4 145 aa27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 PPM1EQ8WY54 764 aa27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPBP1Q9NZL4 362 aa27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRSQ13332 1948 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 NCANO14594 1321 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 EPOPA6NHQ4 379 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 CASP8Q14790 479 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 TCEAL1Q15170 157 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 UGCGQ16739 394 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 CBWD6Q4V339 395 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 CBWD3Q5JTY5 395 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 CBWD5Q5RIA9 395 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 SLFN11Q7Z7L1 901 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 TAF4BQ92750 862 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 MED4Q9NPJ6 270 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 RFXAPO00287 272 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.977e-11■■■■■ 42.7
CAPNS1-204ENST00000587718 TLL1O43897 1013 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 EFCAB14O75071 495 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 CAND2O75155 1236 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 DGAT1O75907 488 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM253P0C7T8 217 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 GNAT1P11488 350 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF2H1P32780 548 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 EPC2Q52LR7 807 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 KSR1Q8IVT5 923 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 DBF4BQ8NFT6 615 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 TMC2Q8TDI7 906 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 OSBPL7Q9BZF2 842 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 CERS4Q9HA82 394 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 MYH10P35580 1976 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 LCHNA4D1U4 455 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 GJB5O95377 273 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC57Q8N9N7 239 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 TBX20Q9UMR3 447 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 NRCAMQ92823 1304 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 STBD1O95210 358 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 PEX3P56589 373 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS6KA1Q15418 735 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 SPRED2Q7Z698 418 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM81BQ96LP2 452 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 OAS2P29728 719 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 HADHBP55084 474 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf54Q08AI8 447 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 ANO5Q75V66 913 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXL18Q96ME1 805 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 SELENOOQ9BVL4 669 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 PACSIN1Q9BY11 444 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR88Q9GZN0 384 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 IKZF4Q9H2S9 585 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC9A2Q9UBY0 812 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM49P0CI25 452 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM49CP0CI26 452 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM26DQ5JW98 314 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM102BQ5T8I3 360 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 TPCN2Q8NHX9 752 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 RAD9AQ99638 391 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 COQ4Q9Y3A0 265 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 MTCH2Q9Y6C9 303 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 TRANK1O15050 2925 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF4AO95239 1232 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 GARTP22102 1010 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 NPTX2P47972 431 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 RPAINQ86UA6 219 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 OLIG1Q8TAK6 271 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 PCYT2Q99447 389 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBED2Q9BTP6 218 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 ERAP1Q9NZ08 941 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-204ENST00000587718 ARID2Q68CP9 1835 aa27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms