RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586541.5

PRKAR1A-212, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene PRKAR1A, Length 570 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-212ENST00000586541 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.26□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.26□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.26□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.26□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.26□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF236Q9UL36 1845 aa6.26□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.26□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 GAKO14976 1311 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 VCANP13611 3396 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 TLR2O60603 784 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 CUTAO60888 179 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 RFPL3O75679 317 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF202O95125 648 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 SMC2O95347 1197 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 CRTAMO95727 393 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 FUCA1P04066 466 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 TNNT1P13805 278 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 GNAT2P19087 354 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 RXRAP19793 462 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 CMA1P23946 247 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 TACR1P25103 407 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 LIFRP42702 1097 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 SYKP43405 635 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 TDO2P48775 406 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 GTF2A2P52657 109 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 RCAN1P53805 252 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 CYP4F8P98187 520 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 GUCY1A3Q02108 690 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 SP3Q02447 781 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PPATQ06203 517 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 CRHR2Q13324 411 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PPIL2Q13356 520 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 LSAMPQ13449 338 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 VGLL4Q14135 290 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 SNX17Q15036 470 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC39A14Q15043 492 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PTPAQ15257 358 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 SYCP1Q15431 976 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 RESP18Q5W5W9 173 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 C17orf99Q6UX52 265 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 CEP68Q76N32 757 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 USP33Q8TEY7 942 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 ANKRD7Q92527 254 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 WASF1Q92558 559 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PHKBQ93100 1093 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 SCLYQ96I15 445 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 KIRREL1Q96J84 757 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 MTA3Q9BTC8 594 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 IDI2Q9BXS1 227 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 KRT23Q9C075 422 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 RNF32Q9H0A6 362 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 ARMT1Q9H993 441 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 KCND1Q9NSA2 647 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 HPSEQ9Y251 543 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 BIN1O00499 593 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 IKBKBO14920 756 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 RASGRP1O95267 797 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 IFNAR1P17181 557 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 FPR2P25090 351 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 37.2
PRKAR1A-212ENST00000586541 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 GYG1P46976 350 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 CORO7P57737 925 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 TMC6Q7Z403 805 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 LCORLQ8N3X6 602 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 LZTR1Q8N653 840 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 FAM151AQ8WW52 585 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 NINJ1Q92982 152 aa6.24□□□□□ -1.41
PRKAR1A-212ENST00000586541 TEKT1Q969V4 418 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms